慢性尿道炎时，病变主要位于后尿道、膀胱颈和膀胱三角区。尿道外口因慢性炎症可呈瘢痕收缩，因此，尿线变细，排尿不畅。但尿路刺激征多不显著，有时清晨可见少量浆性分泌物粘着于尿道口。
此外，临床上，还有一种较为多见的非淋菌性尿道炎，属性传播疾病。它的发生可能与多种病原微生物(如沙眼衣原体、尿素支原体、阴道滴虫及人类疱疹病毒等)有关。

其诊断的主要依据为：尿道炎的症状和体征，尿道分泌物涂片镜检多核白细胞≥5个/高倍视野(×1000����sm) ，或尿沉渣镜检，多核白细胞≥15个/高倍视野(×400），淋球菌培养阴性。