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宫颈形成是复杂的过程，包括内胚层和外胚层来源的组织，副中肾管延伸与融合，尾端组织增厚与泌尿生殖窦及侧方中肾管接触。宫颈闭锁包括早期副中肾管延伸与颈管形成时发生的发育失常。延伸的副中肾管尾端与泌尿生殖窦接触形成宫颈与阴道。如延伸部分缺陷发生宫颈与阴道闭锁。宫颈闭锁患者中约半数有阴道闭锁，但半数阴道正常，说明副中肾管延伸正常，因此宫颈发育异常亦可发生于晚期颈管形成过程中的发育障碍。

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