用免疫组化及电镜检查反复炎症发作，或有感染灶或有肥大的三种扁桃体，证实其中存在两种巨噬细胞，即单核-巨噬细胞及树突状细胞。这两类细胞在淋巴上皮内及上皮之下的分布密度相似，均具有吞噬外来抗原的作用。

３.神经反射功能

　　人体具有免疫功能的组织与神经系统有联系，包括儿茶酚胺在内，至少有数种生理活性物质具有这种联系作用。支配扁桃体的自主神经和感觉神经为免疫系统直接向中枢神经系统传递信息的径路。扁桃体同脾脏和淋巴结等淋巴组织一样，是受多种神经肽支配。

４.对内分泌的影响

　　扁桃体与甲状腺关系密切，发炎的扁桃体对甲状腺可发生毒性影响，引起甲状腺肿及甲状腺功能亢进。也有人认为扁桃体病变先直接影响肾上腺皮质及垂体，再间接影响甲状腺。扁桃体还可能有抑制发育生长的内分泌素，或有调节钙离子和碳水化合物新陈代谢的作用。

５.消化作用

　　在生理关系上，扁桃体似应属于消化系统的器官，在消化过程中，有大量的单核细胞由扁桃体内形成而进入口腔，且有产生吞噬细菌和酶的作用。扁桃体上窝内有waber腺，这是一组管状粘液腺，由20-25个粘液腺体结构组成，其共用导管分布至扁桃体包膜，开口于扁桃体表面，其分泌物被认为有助于扁桃体窝内食物残渣的消化。扁桃体切除术后，患者出现咽干症状可能与切除了该腺体有关，此腺体的化脓性炎症亦是扁桃体周围脓肿的原因之一[2]。