历经发醇，中药材在微生物菌种的功效下有毒物质被溶解，进而药品的毒副作用减少了。以黄连为例子，融合型蒽醌化合物(二蒽醌番泻苷)是其造成泻下功效的主要成分，以便缓解黄连对消化道的这类副作用，临床医学运用中就需要选用中药炮制方式把融合型蒽醌化合物溶解或毁坏掉。有关专家学者研究表明，选用发酵法中药炮制黄连，发醇后融合型蒽醌化合物成分减少，而具备抗肿瘤功效的矿酸型蒽醌的成分提升了6倍，进而改变了黄连的蒽醌类成份的成分，做到了减毒提质增效的功效。

中药材发酵技术是在中药材理论基础上，与当代生物科技极致融合，已逐渐变成中药新药科学研究开发设计的关键方式，为中药材改善制剂、扩张医治范畴及中药新药研制出示了新的方式，因而中药材发酵技术终将有宽阔的发展前途。