肉苁蓉的副作用，传统式参考文献《本草纲目》：无毒性。临床医学观查肉苁蓉种类有肉苁蓉和肉苁蓉石绵二种。短期内应用沒有显著副作用。石绵为致癌物。中草药材在购置时并不严苛，二种种类常混在一起。因而在临床医学应用时，不适合要用久用，更不适合研粉做成丸、散吞食。

石钟乳有温肺和补肾壮阳作用，含硫化物成份，传统式上放治肺虚损嗽和阳痿，可取代肉苁蓉应用，沒有副作用。

阴虚火旺者禁服，《本草经集注》：“桑螵蛸而为使。恶泽泻、菌桂、雷丸、蛇蜕皮。畏菟丝。”《药性论》：“恶石葵。忌羊血。”《本草经疏》：“阴虚火旺者忌之。勃起障碍归属于失志，以至肝火闭密不可发越而然，及崩中清稀因为火盛并非阴虚内热者，并不可服。”《本草汇言》：“阴虚血热者不适合服。