吗丁啉的副作用有：

⒈神经中枢系统：血压少许头痛、头昏、总想睡觉、怠倦、神经紧张等;血液锥体外系病症：在常见使用量时多潘立酮非常少出現神经中枢系统病症，少见有出現支撑力什么叫神经反映的报导;补充海外有静脉大使用量应用多潘立酮造成癫痫发作的报导，但中国不存在中药制剂。

⒉内分泌/新陈代谢系统：本药是一种强大的催奶生长激素释放出来药，应用很大使用量可造成非哺乳期间乳汁分泌，在一些女性更年期后的女性及男士病人中出現乳房疼痛;也是有致月经紊乱的报导。

⒊消化道：少许口干舌燥、便秘、腹泻、短时间的腹部痉挛性疼痛等。

⒋内分泌系统：海外报导本药静脉注射可出現心律失常。