利奈唑胺最普遍的不良反应为腹泻、头痛和恶心想吐。别的不良反应有呕吐、失眠、便秘、皮疹、头昏、发热、口腔念珠菌病、阴道念珠菌病、细菌感染、部分腹痛、消化不良、味蕾改变、舌掉色、发痒。

利奈唑胺发售后常见于报导的副作用有骨髓抑制(包含贫血、白细胞减少、各种红细胞降低和血小板低)、周围神经病和眼睛神经病(有的进度至双目失明)、乳酸菌性代谢性酸中毒。这种副作用关键出現在服药時间太长(超出28天)的病人中。利奈唑胺共用5-5羟色胺类药(包含抗焦虑药如：可选择性5-5羟色胺再摄入缓聚剂[ssris])的病人中，有5-5羟色胺综合症的报导。

忌讳：本产品禁止使用于己知对利奈唑胺或本产品别的成分皮肤过敏的病人。(利奈唑胺注射液中的非特异性成份有：枸橼酸钠、枸橼酸、葡萄糖。利奈唑胺内服干混悬剂中含苯丙氨酸)