第三，黄连上清丸最好是不必与环丙沙星(氟哌酸)同屏。黄连上清丸中带有碳酸氢钙，与环丙沙星同屏时，钠离子与环丙沙星会产生一种钙络离子，这类钙络离子会使药品的溶解性降低，使肠胃无法消化吸收，进而减少药品的功效。因此 ，如必不可少服食，最好是间距2—3钟头。

自然，和黄连上清丸是“怨家”的并非环丙沙星一种，别的的一些药物，如左氧氟沙星、磺胺类抗菌药物、硫酸铝、乳酶生、整肠生、苯巴比妥钠、洋地黄类等，和黄连上清丸同屏，有的会相互之间影响消化吸收，有的会使药力太强或减少，有的会加剧毒副作用，因此 都应防止同屏。