咳嗽变异型哮喘的诊断要综合考虑临床特点，结合支气管激发试验或支气管舒张试验阳性，以及支气管舒张剂治疗有效，可确诊本病。

部分咳嗽变异型哮喘患者也可表现为咽部黏膜的充血肿胀，有人称之为慢性过敏性咽炎。

胃食管反流病

胃食管反流病误诊为慢性咽炎仅次于咳嗽变异型哮喘。

胃内容物反流至食管时，患者常伴有典型的烧心、反酸等症状，称为胃食管反流病；

如果患者出现明显的咳嗽，则被称为胃食管反流病相关性咳嗽，可能和胃内容物反流至咽喉有关。

反流物直接损伤咽部黏膜，可引起咽部黏膜及黏膜下的慢性炎症，又被称为慢性反流性咽炎