全国19个省市的部分中医界人士等，组织医药救亡请愿团，要求将中医纳入教育计划，遭北洋政府拒绝，中医界的第一次维权以失败告终。

　　1929年，官方明确提出废除中医。是年2月，在国民党政府召开的第一届中央卫生委员会上，留日医学生余岩(余云岫)提出《废止旧医以扫除医事卫生之障碍案》并获通过。此即废止中医案。

　　早在1917年，余岩即著《灵素商兑》，用西医理论批判《黄帝内经》，搅起了中医存废之争的轩然大波。该书被认为是全面攻击中医的一部代表作。

　　余岩认为，旧医一日不除，民众思想一日不变，新医事业一日不向上，卫生行政一日不能进展，且以激烈的学术批判和政治手法并进。

　　余岩提案一旦实施，中医消亡不可避免。大批中医药人士纷纷抗议，成立全国医药团体联合会，组成请愿团，推举代表赴南京国民党政府请愿，要求立即取消议案。医'学教育网收集整理时任卫生部长的薛笃弼，向请愿代表表态：我当一天部长，决不容许这个提案获得实行。

　　王振瑞说：中医界虽然在此次斗争后获得一定胜利，但国民党政府对中医的态度并没有根本改变，他们后来的很多政策令中医陷入困境。

　　中西医的第三次大交锋发生在新中国成立初期。