罕见的副作用有结膜炎和低血压。前面一种主要表现为眼球不适感，怕光，发痒，红眼和水肿，后面一种主要表现为视力下降，头昏，困乏等。长期性大使用量运用每天使用量超过1200mg能致交叉性贫血，白细胞下降，偶有消化道不适感或肝功能异常，偶有血细胞氨基转移酶上升的汇报，断药后均可修复，临床实验中能致畸形胎儿。

如今医疗界针对病毒灵这类药品出現了二种不一样的叫法，有一种叫法觉得病毒灵事实上针对抑止病毒感染并沒有显著的实际效果，因此并不倡导在临床医学上应用这类药品。而如今也有许多的传闻说，病毒灵会对小孩的基因遗传和发肓导致影响，实际上这类叫法是沒有科学论证的。