子宫内膜异位症是一种良性疾病但表现特殊的病理生理现象，病变可种植于不同部位，有再生能力，亦可有远处转移与蔓延。其病因与发病机制至今仍未完全清楚。早年文献主要提出以下三种发病学说：

　　一、种植学说

　　又称经血逆流学说。认为妇女行经时子宫收缩，经血从输卵管逆流，经伞端进入盆腔，混杂在经血中的子宫内膜碎片种植在盆腔腹膜表面而继续生长，并在卵巢激素的直接作用下，发生周期性的变化。大量动物实验和临床证据均支持种植学说。

　　二、体腔上皮化生学说

　　认为在胚胎发育的过程中，体腔上皮化生为子宫内膜。盆腔腹膜和脏器的浆膜等体腔上皮，在逆流的经血反复刺激与卵巢激素的周期作用下，有可能被激活转化为内膜而成为子宫内膜异位病灶。

　　三、良性转移学说

　　经血逆流不能解释发生在腹腔以外的子宫内膜异位症，如胸腔、脐、四肢、肾、肺、头部等病变。认为子宫内膜细胞可以像恶性肿瘤一样通过淋巴和／或血运的途径向远处转移，但在身体各器官组织中生长发育的内膜基本上是良性的。曾在盆腔或腹股沟的淋巴结中找到异位的子宫内膜，在子宫旁的静脉中亦发现有内膜细胞，均支持此学说。